Abuurista Saxeexa Ku Salaysan LncRNA ee Xidhiidhka Immune-ka Cusub si loo Aqoonsado Bukaanka Adenocarcinoma ee Xajka ee Khatarta Sare leh |BMC Gastroenterology

Kansarka ganaca waa mid ka mid ah burooyinka ugu dhimashada badan adduunka ee leh saadaal xumo.Sidaa darteed, qaab saadaasha saxda ah ayaa loo baahan yahay si loo aqoonsado bukaanada khatarta sare ugu jira kansarka ganaca si loogu habeeyo daaweynta loona hagaajiyo saadaasha bukaankan.
Waxaan helnay The Cancer Genome Atlas (TCGA) adenocarcinoma pancreatic (PAAD) RNAseq xogta xogta UCSC Xena, la aqoonsaday lncRNAs la xiriira difaaca jirka iyada oo loo marayo falanqaynta isku xidhka, oo la aqoonsaday farqiga u dhexeeya TCGA iyo unugyada adenocarcinoma ganaca caadiga ah.DEirlncRNA) oo ka yimid TCGA iyo muujinta unugyada genotype (GTEx) ee unugyada ganaca.Falanqaynta dib-u-celinta lasso oo dheeraad ah ayaa la sameeyay si loo dhiso moodooyinka saxeexa saadaasha.Waxaan xisaabinay aagga qalooca hoostiisa waxaanan go'aaminnay qiimaha goynta ugu wanaagsan ee lagu aqoonsanayo bukaannada qaba adenocarcinoma ee ganaca-sare iyo khatarta hoose.Si loo isbarbardhigo sifooyinka kiliinikada, soo galinta unugyada difaaca jirka, microenvironment immunosuppressive, iyo caabbinta kiimoterabiga ee bukaanada qaba kansarka qanjidhada sare iyo khatarta hoose.
Waxaan aqoonsannay 20 lammaane oo DEirlncRNA ah iyo bukaanno la kooxeeyay iyadoo loo eegayo qiimaha goynta ugu wanaagsan.Waxaan muujinay in qaabkayaga saxeexa saadaasha uu leeyahay waxqabad la taaban karo xagga saadaalinta saadaasha bukaannada qaba PAAD.AUC ee qalooca ROC waa 0.905 saadaasha 1-sano, 0.942 saadaasha 2-sano, iyo 0.966 saadaasha 3-sano.Bukaannada khatarta sare leh waxay lahaayeen heerar badbaado oo hooseeya iyo astaamo caafimaad oo ka sii daran.Waxaan sidoo kale muujinnay in bukaannada khatarta sare leh ay yihiin kuwo difaaca jirka ah oo laga yaabo inay yeeshaan iska caabin immunotherapy.Qiimaynta dawooyinka ka hortagga kansarka sida paclitaxel, sorafenib, iyo erlotinib oo ku salaysan qalabka saadaasha xisaabinta ayaa laga yaabaa inay ku habboonaato bukaanka khatarta sare leh ee PAAD.
Guud ahaan, daraasaddeenu waxay dejisay qaab cusub oo khatarta saadaalinta ah oo ku salaysan irlncRNA oo lammaane ah, taas oo muujisay qiime saadaal ah oo rajo leh bukaannada qaba kansarka ganaca.Qaabkayaga halista saadaalinta ayaa laga yaabaa inuu caawiyo kala soocidda bukaannada qaba PAAD ee ku habboon daaweynta.
Kansarka ganaca waa buro halis ah oo leh heer badbaado oo shan sano ah oo hooseeya iyo darajo sare.Waqtiga cudurka, bukaanada intooda badan waxay ku jiraan marxalado horumarsan.Marka la eego macnaha guud ee faafitaanka COVID-19, dhakhaatiirta iyo kalkaaliyayaasha caafimaadku waxa ay saaran yihiin cadaadis aad u weyn marka ay daweynayaan bukaannada qaba kansarka ganaca, qoysaska bukaanku waxa ay sidoo kale la kulmaan cadaadisyo badan marka ay go'aannada daawaynta samaynayaan [1, 2].Inkasta oo horumar weyn laga sameeyay daaweynta DOADs, sida daaweynta neoadjuvant, dib-u-soo-celinta qalliinka, daaweynta shucaaca, kiimoterabiga, daaweynta molecular ee bartilmaameedka ah, iyo xakameynta isbaarada difaaca (ICIs), kaliya qiyaastii 9% bukaannada ayaa noolaada shan sano ka dib cudurka [3] ].], 4].Sababtoo ah calaamadaha ugu horreeya ee adenocarcinoma ee ganaca waa kuwo aan caadi ahayn, bukaannada waxaa badanaa lagu ogaadaa metastases marxalad hore [5].Sidaa darteed, bukaanka la siiyay, daaweyn dhamaystiran oo shakhsi ahaaneed waa in ay miisaamaysaa faa'iidooyinka iyo faa'iido darrada dhammaan xulashooyinka daaweynta, ma aha oo kaliya in ay sii dheeraato badbaadada, laakiin sidoo kale si loo hagaajiyo tayada nolosha [6].Sidaa darteed, qaabka saadaalinta wax ku oolka ah ayaa lagama maarmaan u ah in si sax ah loo qiimeeyo saadaasha bukaanka [7].Haddaba, daawaynta ku habboon ayaa la dooran karaa si loo dheellitiro badbaadada iyo tayada nolosha bukaannada qaba PAAD.
Saadaasha liidata ee PAAD waxay inta badan sabab u tahay caabbinta daawooyinka kemotherabi.Sanadihii la soo dhaafay, ka hortagga isbaarada difaaca ayaa si weyn loogu isticmaalay daaweynta burooyinka adag [8].Si kastaba ha ahaatee, isticmaalka ICI-yada ee kansarka ganaca waa dhif in lagu guuleysto [9].Sidaa darteed, waxaa muhiim ah in la aqoonsado bukaannada laga yaabo inay ka faa'iidaystaan ​​daawaynta ICI.
RNA aan codayn dheer (lncRNA) waa nooc ka mid ah RNA aan codeeyn oo leh qoraalo>200 nucleotide.LncRNAs waa baahsan yihiin oo waxay ka kooban yihiin 80% qoraallada aadanaha [10].Shaqa weyn oo shaqo ayaa muujisay in moodooyinka saadaasha ee ku saleysan lncRNA ay si wax ku ool ah u saadaalin karaan saadaasha bukaanka [11, 12].Tusaale ahaan, 18 lncRNA-yada la xidhiidha autophagy-ga ayaa loo aqoonsaday inay abuuraan saxeexyo saadaalin ah oo kansarka naasaha ah [13].Lix kale oo la xiriira difaaca jirka lncRNA ayaa loo isticmaalay si loo dhiso astaamaha saadaasha ee glioma [14].
Kansarka ganaca, cilmi-baadhisyada qaarkood waxay dejiyeen saxiixyo ku salaysan lncRNA si loo saadaaliyo saadaasha bukaanka.Saxeexa 3-lncRNA waxaa lagu aasaasay adenocarcinoma pancreatic oo leh aag ka hooseysa qalooca ROC (AUC) ee kaliya 0.742 iyo guud ahaan badbaadada (OS) ee sanadaha 3 [15].Intaa waxaa dheer, qiimaha muujinta lncRNA waxay ku kala duwan yihiin genomes kala duwan, qaabab xog kala duwan, iyo bukaanno kala duwan, iyo waxqabadka qaabka saadaalintu waa mid aan degganeyn.Sidaa darteed, waxaan isticmaalnaa qaabeynta cusub ee algorithm, lammaanaynta iyo soo noqnoqoshada, si aan u abuurno saxeexyada lncRNA (irlncRNA) difaaca-xidhiidhka ah si aan u abuurno nooc saadaalin ah oo sax ah oo xasilloon [8].
Xogta RNAseq ee caadiga ah (FPKM) iyo kansarka qanjidhada kiliinikada ee TCGA iyo xogta unugyada genotype (GTEx) ayaa laga helay xogta UCSC XENA (https://xenabrowser.net/datapages/).Faylasha GTF waxaa laga helay xogta Ensembl (http://asia.ensembl.org) waxaana loo isticmaalay in laga soo saaro astaamaha muujinta lncRNA ee RNAseq.Waxaan ka soo dejinay hiddo-wadaha la xiriira difaacidda xogta ImmPort (http://www.immport.org) waxaanan aqoonsannay lncRNAs (irlncRNAs) difaaca la xiriira annagoo adeegsanayna falanqaynta isku xirnaanta (p <0.001, r> 0.4).Aqoonsiga irlncRNAs si kala duwan loo muujiyay (DEirlncRNAs) iyadoo la gudbayo irlncRNAs oo si kala duwan loo muujiyay lncRNAs laga helay xogta GEPIA2 (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) ee kooxda TCGA-PAAD (|logFC|> 1 iyo FDR) ) <0.05).
Habkan hore ayaa loo soo sheegay [8].Gaar ahaan, waxaan u dhiseynaa X si aan u bedelno lamaanayaasha lncRNA A iyo lncRNA B. Marka qiimaha muujinta lncRNA A uu ka sarreeyo qiimaha lncRNA B, X waxaa lagu qeexay 1, haddii kale X waxaa lagu qeexay 0. Sidaa darteed, waxaan heli karnaa matrix ah 0 ama - 1. dhidibka toosan ee matrixku waxa uu u taagan yahay muunad kasta, dhidibka toosanna waxa uu u taagan yahay lamaane kasta oo DEirlncRNA ah oo leh qiime 0 ama 1 ah.
Falanqaynta dib-u-celinta midaysan oo ay ku xigto dib-u-celinta Lasso ayaa loo isticmaalay in lagu baaro lammaaneyaasha DEirlncRNA ee saadaaliya.Falanqaynta dib-u-celinta lasso waxay adeegsatay 10-laab-laba laab-la-laabasho ah oo lagu celceliyay 1000 jeer (p <0.05), oo leh 1000 kicinta random per orod.Marka inta jeer ee lammaane kasta oo DEirlncRNA uu dhaafo 100 jeer 1000 wareeg, lammaane DEirlncRNA ayaa la doortay si ay u dhisaan moodal khatar ah oo saadaalin ah.Ka dib waxaan u isticmaalnay qalooca AUC si aan u helno qiimaha goynta ugu fican ee u kala soocida bukaanada PAAD kooxo khatar sare iyo kuwo hoose leh.Qiimaha AUC ee nooc kasta ayaa sidoo kale la xisaabiyay oo loo sawiray sidii qalooc ahaan.Haddii qaloocadu gaadho meesha ugu sarraysa ee muujinaysa qiimaha ugu sarreeya ee AUC, habka xisaabinta ayaa joogsata oo moodeelka waxaa loo tixgeliyaa musharaxa ugu fiican.1-, 3- iyo 5-sano ROC moodooyinka qalooca ayaa la dhisay.Falanqaynta dib-u-celinta kala-duwanaanshaha iyo kala-duwanaanshaha badan ayaa loo isticmaalay si loo baaro waxqabadka saadaasha madax-bannaan ee qaabka khatarta saadaasha.
Isticmaal toddobo qalab si aad u barato heerarka soo galinta unugyada difaaca jirka, oo ay ku jiraan XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS, iyo CIBERSORT.Xogta galitaanka unugyada difaaca waxa laga soo dejiyey kaydka TIMER2 (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3).Farqiga u dhexeeya unugyada difaaca jirka ee u dhexeeya kooxaha khatarta sare iyo kuwa hooseeya ee qaabka la dhisay ayaa lagu falanqeeyay iyada oo la adeegsanayo imtixaanka darajada ee Wilcoxon, natiijooyinka waxaa lagu muujiyay garaafka labajibbaaran.Falanqaynta isku xirka Spearman ayaa la sameeyay si loo falanqeeyo xiriirka ka dhexeeya qiyamka dhibcaha halista iyo unugyada difaaca jirka.Isku xidhka isku xidhka ee ka dhashay waxa loo muujiyay nacnac ahaan.Heerka muhiimada waxaa lagu dejiyay p <0.05.Habka waxaa lagu sameeyay xirmada R ggplot2.Si loo baadho xidhiidhka ka dhexeeya moodeelka iyo heerarka muujinta hidde-sidaha ee la xidhiidha heerka soo galinta unugyada difaaca jirka, waxaanu samaynay xidhmada ggstatsplot iyo muuqaalka muuqaalka muuqaalka violin.
Si loo qiimeeyo qaababka daawaynta kiliinikada ee kansarka ganaca, waxaanu xisaabinay IC50 ee daawooyinka kemotherabi ee inta badan la isticmaalo ee kooxda TCGA-PAAD.Farqiga u dhexeeya kala-duwanaanta kala-badhka xakamaynta (IC50) ee u dhexeeya kooxaha khatarta sare leh iyo kuwa hooseeya ayaa la barbardhigay iyada oo la adeegsanayo imtixaanka darajada saxeexan ee Wilcoxon, natiijooyinkana waxaa lagu muujiyay sida sanduuqyada la sameeyay iyadoo la adeegsanayo pRrophetic iyo ggplot2 ee R. Dhammaan hababka waxay u hoggaansamaan xeerarka iyo xeerarka ku habboon.
Socodka shaqada ee daraasaddeena ayaa lagu muujiyey Jaantuska 1. Isticmaalka falanqaynta isku xidhka ee u dhaxaysa lncRNAs iyo hiddo-wadaha la xidhiidha difaaca, waxaanu dooranay 724 irlncRNAs oo leh p <0.01 iyo r> 0.4.Marka xigta waxaanu falanqeynay lncRNA-yada si ka duwan loo muujiyay ee GEPIA2 (Jaantuska 2A).Wadarta 223 irlncRNAs ayaa si kala duwan loogu muujiyay inta u dhaxaysa adenocarcinoma ganaca iyo unugyada caadiga ah ee ganaca (|logFC|> 1, FDR <0.05), oo lagu magacaabo DEirlncRNAs.
Dhisida moodooyinka halista saadaaliya.(A) Dhulka Volcano ee lncRNAs si ka duwan loo muujiyey.(B) Qaybinta isku xidhka lasso ee 20 lammaane oo DEirlncRNA ah.(C) Kala duwanaanshiyaha suurtagalka ah ee qaybinta isku-dhafka LASSO.(D) Sawirka kaynta oo muujinaya falanqaynta dib u noqoshada kala duwan ee 20 DEirlncRNA.
Marka xigta waxaanu dhisnay 0 ama 1 matrix annagoo ku lammaanayna 223 DEirlncRNAs.Wadarta 13,687 lammaane DEirlncRNA ayaa la aqoonsaday.Ka dib falanqaynta regression-ka midaysan iyo lasso, 20 DEirlncRNA lammaane ayaa ugu dambeyntii la tijaabiyay si loo dhiso qaabka halista saadaalinta (Jaantuska 2B-D).Iyada oo ku saleysan natiijooyinka Lasso iyo falanqaynta dib-u-celinta badan, waxaanu xisaabinay dhibcaha halista bukaan kasta oo ka tirsan kooxda TCGA-PAAD (Shaxda 1).Iyada oo ku saleysan natiijooyinka falanqaynta dib-u-celinta lasso, waxaanu xisaabinay dhibcaha halista bukaan kasta oo ka tirsan kooxda TCGA-PAAD.AUC ee qalooca ROC wuxuu ahaa 0.905 ee saadaasha moodada khatarta ah ee 1-sano, 0.942 saadaasha 2-sano, iyo 0.966 saadaasha 3-sano (Jaantus 3A-B).Waxaan dejinay qiimaha goynta ugu wanaagsan ee 3.105, waxaanu u dejinay bukaanada kooxda TCGA-PAAD kooxo khatartoodu sarreyso iyo mid hoose, waxaananu qorshaynay natiijooyinka badbaadada iyo qaybinta dhibcooyinka halista bukaan kasta (Jaantuska 3C-E).Falanqaynta Kaplan-Meier waxay muujisay in badbaadada bukaannada PAAD ee kooxda khatarta sare leh ay aad uga hooseeyaan kuwa bukaannada ku jira kooxda khatarta hoose (p <0.001) (Jaantus 3F).
Xaqiijinta moodooyinka halista saadaasha.(A) ROC ee qaabka halista saadaalinta.(B) 1-, 2-, iyo 3-sano ROC moodooyinka halista saadaalinta.(C) ROC ee qaabka halista saadaaliska.Waxay tusinaysaa meesha ugu wanaagsan ee goynta(DE) Qaybinta heerka badbaadada (D) iyo buundooyinka halista (E).(F) Falanqaynta Kaplan-Meier ee bukaannada PAAD ee kooxaha khatarta sare iyo kuwa hooseeya.
Waxaan sidoo kale ku qiimeynay kala duwanaanshaha buundooyinka halista sifooyin caafimaad.Sawirka xariijinta (Jaantuska 4A) wuxuu muujinayaa xidhiidhka guud ee ka dhexeeya sifooyinka bukaan-socodka iyo buundooyinka halista.Gaar ahaan, bukaannada da'da weyn waxay lahaayeen dhibcooyin halis sare ah (Jaantuska 4B).Intaa waxaa dheer, bukaanada qaba marxaladda II waxay lahaayeen dhibcooyin halis ah oo sarreeya marka loo eego bukaanka marxaladda I (Jaantus 4C).Marka laga hadlayo darajada buro ee bukaannada PAAD, bukaannada fasalka 3 waxay lahaayeen buundooyin halis ah oo ka sarreeya bukaannada fasalka 1 iyo 2 (Jaantuska 4D).Waxaan sii wadnay samaynta falanqaynta dib-u-celinta kala-duwanaanshaha iyo kala-duwanaanta waxayna muujisay dhibcaha khatarta ah (p <0.001) iyo da'da (p = 0.045) waxay ahaayeen arrimo saadaasha madax-bannaan ee bukaannada qaba PAAD (Jaantus 5A-B).Qalooca ROC wuxuu muujiyay in dhibcaha khatarta ahi ay ka sarreeyaan sifooyinka kale ee kiliinikada ee saadaalinta 1-, 2-, iyo 3-sano ee badbaadada bukaanada qaba PAAD (Jaantus 5C-E).
Astaamaha kiliinikada ee moodooyinka halista saadaasha.Histogram (A) wuxuu muujinayaa (B) da'da, (C) heerka burada, (D) heerka burada, buundada halista, iyo jinsiga bukaanka kooxda TCGA-PAAD.** p <0.01
Falanqaynta saadaasha madax-bannaan ee moodooyinka halista saadaasha.(AB) Univariate (A) iyo multivariate (B) falanqaynta dib-u-celinta ee moodooyinka halista saadaasha iyo sifooyinka caafimaad.(CE) 1-, 2-, iyo 3-sano ROC ee moodooyinka halista saadaalinta iyo astaamaha caafimaad
Sidaa darteed, waxaan baarnay xiriirka ka dhexeeya waqtiga iyo dhibcaha halista.Waxaan ogaanay in dhibcaha khatarta ah ee bukaannada PAAD ay si aan kala sooc lahayn ula xiriireen unugyada CD8 + T iyo unugyada NK (Jaantus 6A), taas oo muujinaysa shaqada difaaca ee la xakameynayo ee kooxda khatarta sare leh.Waxaan sidoo kale qiimeynay farqiga u dhexeeya unugyada difaaca jirka ee u dhexeeya kooxaha khatarta sare iyo kuwa hooseeya waxaana helnay natiijooyin isku mid ah (Jaantus 7).Waxaa yaraa soo galitaanka unugyada CD8+ T iyo unugyada NK ee kooxda khatarta sare leh.Sanadihii la soo dhaafay, xakamaynta isbaarada difaaca (ICIs) ayaa si weyn loogu isticmaalay daaweynta burooyinka adag.Si kastaba ha ahaatee, isticmaalka ICI-yada ee kansarka ganaca waa dhif in lagu guuleysto.Sidaa darteed, waxaan qiimeynay muujinta hiddo-wadaha isbaarada difaaca ee kooxaha khatarta sare iyo kuwa hooseeya.Waxaan ogaanay in CTLA-4 iyo CD161 (KLRB1) ay si xad dhaaf ah u muujiyeen kooxda khatarta hoose (Jaantuska 6B-G), taas oo muujinaysa in bukaannada PAAD ee kooxda khatarta hoose ay u nugul yihiin ICI.
Falanqaynta isku dhafka ah ee qaabka halista saadaalinta iyo galitaanka unugyada difaaca.(A) Xidhiidhka ka dhexeeya qaabka halista saadaalinta iyo galitaanka unugyada difaaca.(BG) Waxay muujinaysaa muujinta hidda-wadaha ee kooxaha khatarta sare iyo kuwa hooseeya.(HK) Qiimaha IC50 ee daawooyinka gaarka ah ee ka hortagga kansarka ee kooxaha khatarta sare iyo kuwa hoose.*p <0.05, **p <0.01, ns = muhiim maaha
Waxaanu sii qiimaynay xidhiidhka ka dhexeeya buundooyinka halista iyo wakiilada kiimoterabiga caadiga ah ee kooxda TCGA-PAAD.Waxaan ka raadinay dawooyinka ka hortagga kansarka ee sida caadiga ah loo isticmaalo kansarka ganaca waxaana la falanqeeyay faraqa u dhexeeya qiyamkooda IC50 ee u dhexeeya kooxaha khatarta sare leh iyo kuwa hooseeya.Natiijooyinku waxay muujiyeen in qiimaha IC50 ee AZD.2281 (olaparib) uu ka sarreeyay kooxda khatarta sare leh, taas oo muujinaysa in bukaannada PAAD ee kooxda khatarta sare leh ay u adkeysan karaan daaweynta AZD.2281 (Jaantus 6H).Intaa waxaa dheer, qiyamka IC50 ee paclitaxel, sorafenib, iyo erlotinib ayaa ka hooseeya kooxda khatarta sare leh (Jaantus 6I-K).Waxaan sidoo kale aqoonsannay 34 dawooyinka kansarka ka hortagga ah ee leh qiyamka sare ee IC50 ee kooxda khatarta sare leh iyo 34 dawooyinka kansarka oo leh qiyamka IC50 hoose ee kooxda khatarta sare leh (Shaxda 2).
Lama dafiri karo in lncRNAs, mRNAs, iyo miRNAs ay si weyn u jiraan oo ay door muhiim ah ka ciyaaraan horumarinta kansarka.Waxaa jira cadeymo badan oo taageeraya doorka muhiimka ah ee mRNA ama miRNA ee saadaalinta badbaadada guud ee dhowr nooc oo kansar ah.Shaki la'aan, moodooyin badan oo halista saadaaliya ayaa sidoo kale ku saleysan lncRNAs.Tusaale ahaan, Luo et al.Daraasaduhu waxay muujiyeen in LINC01094 ay door muhiim ah ka ciyaarto kororka PC-ga iyo metastasis-ka, iyo muujinta sare ee LINC01094 waxay muujineysaa badbaadada liidata ee bukaanka kansarka ganaca [16].Daraasada oo ay soo bandhigtay Lin et al.Daraasaduhu waxay muujiyeen in hoos-u-dhigga lncRNA FLVCR1-AS1 ay la xiriirto saadaasha liidata ee bukaanka kansarka ganaca [17].Si kastaba ha noqotee, lncRNA-yada la xiriira xasaanadda ayaa aad looga wada hadlay marka la eego saadaalinta guud ahaan badbaadada bukaannada kansarka.Dhawaan, tiro badan oo shaqo ah ayaa diiradda lagu saaray dhismaha moodooyinka khatarta ah ee saadaalinta si loo saadaaliyo badbaadada bukaanka kansarka oo markaa la hagaajiyo hababka daaweynta [18, 19, 20].Waxaa jira aqoonsi sii kordhaya ee doorka muhiimka ah ee difaaca jirka ee soo dhexgalka ee bilowga kansarka, horumarka, iyo ka jawaab celinta daawaynta sida kiimoterabiga.Daraasado badan ayaa xaqiijiyay in unugyada difaaca jirka ee buro ay door muhiim ah ka ciyaaraan jawaabta chemotherapy cytotoxic [21, 22, 23].Unugyada difaaca jirka ee buro ayaa ah arrin muhiim u ah badbaadada bukaanada buro [24, 25].Immunotherapy, gaar ahaan daawaynta ICI, ayaa si weyn loogu isticmaalaa daawaynta burooyinka adag [26].Hidde-sideyaasha difaaca jirka ayaa si weyn loo isticmaalaa si loo dhiso moodooyinka halista saadaalinta.Tusaale ahaan, Su et al.Qaabka halista saadaasha ee la xiriirta difaaca jirka wuxuu ku saleysan yahay hidda-sidaha borotiinka-koodka si loo saadaaliyo saadaasha bukaannada kansarka ugxan-sidaha [27].Hidde-sideyaasha aan codeeyn sida lncRNAs sidoo kale waxay ku habboon yihiin dhisidda moodooyinka halista saadaalinta [28, 29, 30].Luo et al waxay tijaabisay afar lncRNAs oo difaaca jirka ah waxayna dhiseen qaab saadaalin ah khatarta kansarka ilmo galeenka [31].Khan iyo al.Wadarta qoraallada 32 ee kala duwan ayaa la aqoonsaday, iyada oo taas ku saleysan, qaab saadaal ah oo leh 5 qoraallo muhiim ah ayaa la aasaasay, kaas oo loo soo jeediyay sidii qalab aad loogu taliyey oo lagu saadaaliyay biopsy-caddaysay diidmo degdeg ah ka dib beerista kelyaha [32].
Inta badan moodooyinkaan waxay ku saleysan yihiin heerarka muujinta hidde-sidaha, ama hiddo-wadaha codeeynta borotiinka ama hiddo-wadaha aan codeeyn.Si kastaba ha noqotee, isla hidde-sidaha isku midka ah wuxuu yeelan karaa qiyamka muujinta kala duwan ee genome-yada kala duwan, qaababka xogta iyo bukaannada kala duwan, taasoo horseedaysa qiyaaso aan xasilloonayn moodooyinka saadaalinta.Daraasaddan, waxaan ku dhisnay qaab macquul ah oo leh laba lammaane oo lncRNA ah, oo ka madax bannaan qiyamka hadalka saxda ah.
Daraasaddan, waxaan ku aqoonsannay irlncRNA markii ugu horeysay iyada oo loo marayo falanqaynta isku xidhka ee hiddo-wadaha la xiriira difaaca.Waxaan ku baarinay 223 DEirlncRNAs annagoo isku-dhafan leh lncRNAs si ka duwan loo muujiyey.Marka labaad, waxaanu dhisnay 0-ama-1 matrix ku salaysan habka lammaanaynta DEirlncRNA ee la daabacay [31].Ka dib waxaanu samaynay falanqayn midaysan iyo lasso regression si loo aqoonsado lammaanaha DEirlncRNA ee saadaaliya oo aan u dhisno qaab khatar ah oo saadaaliya.Waxaan sii falanqeynay xiriirka ka dhexeeya buundooyinka halista iyo sifooyinka bukaan-socodka ee bukaannada qaba PAAD.Waxaan ogaanay in qaabkayaga khatarta ah ee khatarta ah, oo ah arrin madax-bannaan oo saadaalin ah oo ku jirta bukaannada PAAD, ay si wax ku ool ah u kala saari karaan bukaannada darajada sare ee bukaannada hooseeya iyo bukaannada heerka sare ee bukaannada darajada hoose.Intaa waxaa dheer, qiyamka AUC ee qalooca ROC ee qaabka halista saadaalinta waxay ahaayeen 0.905 saadaasha 1-sano, 0.942 ee saadaasha 2-sano, iyo 0.966 ee saadaasha 3-sano.
Cilmi-baadhayaashu waxay soo sheegeen in bukaannada qaba CD8 + T unuggu ay aad ugu nugul yihiin daaweynta ICI [33].Kordhinta maadada unugyada cytotoxic, unugyada CD56 NK, unugyada NK iyo unugyada CD8+ T ee ku jira unugyada difaaca jirka ee buro waxay noqon kartaa mid ka mid ah sababaha saamaynta xakamaynta buro [34].Daraasadihii hore waxay muujiyeen in heerarka sare ee CD4 (+) T iyo CD8 (+) T ay si weyn ula xiriiraan badbaadada dheer [35].Unugyada CD8 T ee liidata, culeyska neoantigen hooseeya, iyo buro microenvironment ah oo difaac adag leh ayaa horseedaya jawaab celin la'aanta daaweynta ICI [36].Waxaan ogaanay in dhibcaha khatarta ah ay si xun ula xiriireen unugyada CD8+ T iyo unugyada NK, taas oo muujinaysa in bukaanada leh dhibcooyinka khatarta sare leh laga yaabo inaysan ku haboonayn daaweynta ICI oo ay leeyihiin saadaal ka sii xun.
CD161 waa calaamade unugyada dilaaga dabiiciga ah (NK).CD8+CD161+ CAR-transduced T unugyada dhexdhexaadinta vivo waxtarka antitumor ee HER2+ pancreatic ductal adenocarcinoma xenograft moodooyinka [37].Kahortagga isbaarada difaaca waxay beegsadaan cytotoxic T lymphocyte ee ku xiran borotiinka 4 (CTLA-4) iyo borotiinka dhimashada unugyada barnaamijka 1 (PD-1)/dariiqyada dhimashada unugyada ee barnaamijka 1 (PD-L1) waxayna leeyihiin awood weyn meelo badan.Muujinta CTLA-4 iyo CD161 (KLRB1) way ka hooseeyaan kooxaha khatarta sare leh, taas oo sii muujinaysa in bukaanada leh buundooyinka khatarta sare leh laga yaabo inaysan u qalmin daaweynta ICI.[38]
Si loo helo ikhtiyaarrada daaweynta ee ku habboon bukaannada khatarta sare leh, waxaan falanqeynnay dawooyinka kansarka ee kala duwan waxaana ogaanay in paclitaxel, sorafenib, iyo erlotinib, oo si weyn loogu isticmaalo bukaannada qaba PAAD, ay ku habboonaan karaan bukaannada khatarta sare leh ee PAAD.[33]Zhang et al waxay ogaatay in isbeddelka ku yimid dariiq kasta oo DNA ah oo waxyeello ah (DDR) ay u horseedi karto saadaal xumo bukaanka kansarka qanjirka 'prostate' [39].Tijaabada Kansarka Kansarka ee Olaparib (POLO) waxay muujisay in daawaynta dayactirka ee olaparib ay daba-dheeraatay badbaadada horumarka-la'aanta ah marka la barbar dhigo placebo ka dib kiimiko-ku-saleysan platinum-ku-saleysan ee bukaannada qaba adenocarcinoma ductal pancreatic iyo germline BRCA1/2 mutations [40].Tani waxay bixisaa rajo weyn oo ah in natiijooyinka daawaynta ay si weyn u fiicnaan doonaan kooxdan hoose ee bukaanka.Daraasaddan, qiimaha IC50 ee AZD.2281 (olaparib) ayaa ka sarreeya kooxda khatarta sare leh, taas oo muujinaysa in bukaannada PAAD ee kooxda khatarta sare leh ay u adkeysan karaan daaweynta AZD.2281.
Moodooyinka saadaasha ee daraasaddan waxay soo saaraan natiijooyin saadaal ah oo wanaagsan, laakiin waxay ku salaysan yihiin saadaasha falanqaynta.Sida loogu xaqiijiyo natiijooyinkan xogta caafimaad waa su'aal muhiim ah.ultrasonography ee Irbadda Fiican ee Endoscopic (EUS-FNA) waxay noqotay hab lama huraan ah oo lagu ogaanayo nabarrada xameetida ee adag iyo ka baxsan ee leh dareenka 85% iyo gaar ahaan 98% [41].Imaanshaha cirbadaha EUS ganaax-cirbadood (EUS-FNB) waxay inta badan ku saleysan tahay faa'iidooyinka la dareemayo ee FNA, sida saxnaanta ogaanshaha sare, helitaanka muunado ilaalinaya qaab dhismeedka taariikhiga ah, oo sidaas darteed abuura unug difaac oo muhiim u ah baarista qaarkood.wasakh gaar ah [42].Dib-u-eegis nidaamsan oo suugaanta lagu sameeyay ayaa xaqiijiyay in cirbadaha FNB (gaar ahaan 22G) ay muujinayaan waxtarka ugu sarreeya ee goosashada nudaha laga soo qaado xajmiyada ganaca [43].Kiliinik ahaan, tiro yar oo bukaan ah ayaa u qalma qalliinka xagjirka ah, bukaanada badankooduna waxay leeyihiin burooyin aan shaqaynayn wakhtiga hore ee cudurka.Dhaqdhaqaaqa bukaan-socodka, kaliya qayb yar oo bukaanno ah ayaa ku habboon qalliinka xagjirka ah sababtoo ah bukaannada intooda badan waxay leeyihiin burooyin aan shaqaynayn wakhtiga hore ee cudurka.Ka dib xaqiijinta cudurada EUS-FNB iyo habab kale, daaweynta caadiga ah ee aan qalliinka ahayn sida kiimoterabiga ayaa badanaa la doortaa.Barnaamijkeena cilmi baarista ee soo socda waa in aan tijaabino qaabka saadaalinta daraasaddan ee kooxaha qalliinka iyo kuwa aan qalliinka ahayn iyada oo loo marayo falanqayn dib-u-eegis ah.
Guud ahaan, daraasaddeenu waxay dejisay qaab cusub oo khatarta saadaalinta ah oo ku salaysan irlncRNA oo lammaane ah, taas oo muujisay qiime saadaal ah oo rajo leh bukaannada qaba kansarka ganaca.Qaabkayaga halista saadaalinta ayaa laga yaabaa inuu caawiyo kala soocidda bukaannada qaba PAAD ee ku habboon daaweynta.
Xogta la isticmaalay oo lagu falanqeeyay daraasadda hadda jirta waxa laga heli karaa qoraaga u dhiganta codsi macquul ah.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Doorka dhexdhexaadinta ee wax-ku-oolnimada nafta ee habaynta shucuureed ee shucuurta taban inta lagu jiro masiibada COVID-19: daraasad-qaybeed.Int J Ment Health Kalkaaliyaasha [maqaal joornaal].2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, iyo al.Aragtida xubnaha qoyska ee go'aan gaarista beddelka ah ee qaybaha daryeelka degdegga ah: dib u eegis nidaamsan.INT J NURS STUD [maqaal wargeys;dib u eegis].2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Kansarka ganaca.Lancet.[Maqaalka Joornaalka;taageerada cilmi-baarista, NIH, ka baxsan;taageerada cilmi-baarista, dawladda ka baxsan Maraykanka;dib u eegis].2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Epidemiology ee kansarka ganaca.Joornaalka Adduunka ee Gastroenterology.[Maqaal joornaal, dib u eegis].2016 11/28/2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nomogram cusub oo tp53 la xidhiidha saadaalinta guud ahaan badbaadada bukaanada qaba kansarka ganaca.BMC Cancer [journal article].2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X. Chen YKalkaalisada kansarka.[Maqaalka Joornaalka;tijaabinta la kala soocay;daraasadda waxaa taageeray dawlad ka baxsan Maraykanka].2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, iyo al.Heerarka antigen ee kansarka mindhicirka kadib qalliinka kadib waxay saadaaliyaan natiijada ka dib markii kansarka mindhicirka laga soo saaro bukaanada leh heerka caadiga ah ee CEA qalliinka ka hor.Xarunta Cilmi-baarista Kansarka Turjubaanka.[Maqaal joornaal].2020 01.01.2020;9 (1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, iyo al.lncRNA-yada la xiriira difaaca waxay abuuraan saxiixyo cusub waxayna saadaaliyaan muuqaalka difaaca ee kansarka hepatocellular ee bini'aadamka.Mol Ther Nucleic acids [Journal article].2020 2020-12-04;22:937 - 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Immunotherapy ee kansarka ganaca: caqabadaha iyo horumarka.Ann Qalliinka mindhicirka [Maqaal Journal;dib u eegis].2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. RNA-yada dheer ee aan codayn (LncRNAs), genomics buro fayraska ah iyo dhacdooyinka kala-baxa aberrant: saamaynta daweynta.AM J CANCER RES [maqaal joornaal;dib u eegis].2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Aqoonsiga saxeexyada lncRNA ee la xidhiidha saadaasha kansarka endometrial.Guulaha cilmiga [magazine article].2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, iyo al.Falanqaynta dhamaystiran ee hiddo-wadaha saadaalinta borotiinka ee RNA-ku-xidha iyo murashaxiinta daroogada ee kansarka unugyada kelyaha ee papillary.pregen.[Maqaal joornaal].2021 01/20/2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, iyo al.Astaamaha autophagy-ku-xiran ee RNA-da dheer ee aan codayn waxay saadaaliyaan saadaalinta kansarka naasaha.pregen.[Maqaal joornaal].2021 01/20/2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Xidhiidhka difaaca ee lix lncRNA saxeexa wuxuu hagaajiyaa saadaasha glioblastoma multiforme.MOL Neurobiology.[Maqaal joornaal].2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, iyo al.Saxiixa cusub ee tri-lncRNA wuxuu saadaaliyaa badbaadada bukaanka qaba kansarka ganaca.WAKIILADA ONKOL.[Maqaal joornaal].2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 waxay kor u qaadaa horumarka kansarka ganaca iyada oo nidaamisa muujinta LIN28B iyo dariiqa PI3K/AKT ee mara miR-577 isbuunyo leh.Mol Therapeutics - Nucleic acids.2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, iyo al.Jawaab celinta togan ee u dhaxaysa lncRNA FLVCR1-AS1 iyo KLF10 waxay joojin kartaa horumarka kansarka ganaca iyada oo loo marayo dariiqa PTEN/AKT.J EXP Clin Cancer Res.2021;40 (1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Aqoonsiga saddex iyo toban gen oo saadaaliya badbaadada guud ee kansarka hepatocellular.Biosci Rep [maqaal joornaal].2021 04/09/2021.


Waqtiga boostada: Seb-22-2023